El trabajo interinstitucional es importante para la garantía de los derechos. El Consejo Cantonal para la Protección de Derechos tiene vigentes los siguientes convenios y alianzas:
| NOMBRE DE LA ORGANIZACIÓN | OBJETO | FECHA DE INSCRIPCIÓN | CONVENIO |
|---|---|---|---|
| CONAGOPARE | Implementa mecanismos para la prevención y erradicación de la violencia de género de las parroquias rurales del cantón Santo Domingo. | 16/05/2023 |  |
| Fundación AMES | Promoción, activación, integración socioeconómica y el bienestar psicosocial de la población de movilidad humana. | 18/07/2023 | |
| Fundación Calazanz | Garantizar un espacio seguro de sosiego, protección y cuidado temporal. | 01/01/2025 | |
| Radio Más 89.3 FM | Difundir información sobre las acciones, actividades y testimonios de cómo se implementa la política. | 22/04/2025 | |
| AIMME | Campañas, proyectos y talleres de socialización enfocados en la prevención de la violencia intrafamiliar. | 31/03/2025 | |
| FUDELA | Convenio de cooperación interinstitucional entre el Consejo Cantonal de Protección de Derechos del Gobierno Municipal de Santo Domingo de los Tsáchilas (CCPD-SD) y la Fundación de las Américas para el Desarrollo (FUDELA). | 29/05/2025 | |
| GAD Cantonal | Convenio de cooperación interinstitucional entre el Consejo Cantonal de Protección de Derechos y el Gobierno Autónomo Descentralizado Municipal. | 14/06/2025 | |